Em novembro de 2021, a CM de Coimbra e o Governo, por intermédio da Direção Geral do Património Cultural e da Direção Regional de Cultura do Centro, formalizaram o contrato interadministrativo de cooperação com o objetivo da autarquia promover a requalificação do Museu Nacional de Machado de Castro, com financiamento do PRR.
Na reunião de Câmara de 10 de março, a CM de Coimbra aprovou a abertura do concurso público para a execução destas obras de requalificação, com um preço base de 1,7 milhões de euros (M€) e um com prazo de execução de 300 dias.
A empreitada visa a renovação e a reparação de algumas patologias existentes no edifício, que sofreu uma intervenção profunda entre 2006 e 2012, sem lhe retirar as características atuais. O projeto refere um conjunto de trabalhos a realizar, nomeadamente a substituição dos revestimentos de pavimentos, caixilharia e estores; a introdução de linhas de vida e telhas passadeira nas coberturas de telha; o estudo de ventilação do espaço entre o envidraçado do “cubo” e os espaços adjacentes; a alteração do teto na copa e no corredor de entrada da cafetaria; substituição do sistema de fixação dos degraus da escada de caracol de apoio à cozinha; a limpeza e restauro de fachadas; e a limpeza de coberturas de pedra.